青蝦耐低氧能力極差，在養殖以及運輸過程中極易因缺氧而導致死亡，因此，對青蝦耐低氧分子機制開展的研究對青蝦產業發展壯大的重要性不言而喻。針對上述問題，團隊以日本沼蝦為研究對象，結合缺氧時不同生理狀態（存活、瀕死和死亡）下日本沼蝦的肝胰腺代謝組和轉錄組進行比較分析，分別發現了108、86和48種差異表達代謝物（differentially expressed metabolites，DEM）。通過分析發現了32種共有DEM，通過對共有DEM的篩選和低氧應激相關基因聯合分析，鑒定出12個低氧應激相關基因。其中，GTP磷酸烯醇丙酮酸酯羧激酶（PEPCK）是唯一在轉錄組和代謝組中排名均靠前的差異表達基因，因此，它被認為在調控青蝦缺氧應答過程中發揮重要作用。該研究填補了缺氧轉錄組分析片面性的缺口，并從代謝物中反向推斷出幾個與缺氧相關的新基因。本研究有助于說明缺氧脅迫下日本沼蝦相關的分子過程。
該項研究得到了藍色糧倉重點研發計劃（2018YFD0901303）和水科院基本科研業務費項目（2020TD36）等項目的支持。淡水中心水產遺傳育種研究室博士研究生許蕾為第一作者、傅洪拓研究員為通訊作者。
全文網址：https://www.mdpi.com/journal/antioxidants。
2023年4月3日
來源：中國水產科學院
